Coleção modelos

Gráfico de lagarta

Os efeitos aleatórios previstos de um misto, um por nível do grupo, com intervalo e a faixa do desvio padrão.

O que o bloco faz

models/plot_caterpillar Ordena efeitos aleatórios por grupo e mostra intervalos. A saída é view/plot.

Antes de continuar

Termos que esta página usa, em poucas palavras. As definições completas estão no glossário.

Erro padrão
O desvio padrão de uma estimativa: quanto ela variaria se o estudo fosse repetido com outra amostra. Diminui quando a amostra cresce e é a base dos intervalos de confiança e dos testes.
Intervalo de confiança
Uma faixa de valores calculada a partir da amostra. Com 95% de confiança, o procedimento produz intervalos que contêm o valor verdadeiro em 95% das amostras possíveis; não quer dizer que um intervalo específico tenha 95% de probabilidade de acertar.
Variância
A média dos quadrados das distâncias de cada valor à média: mede o quanto os dados se espalham. O desvio padrão é a raiz quadrada da variância e fica na mesma unidade dos dados.
Efeito fixo e efeito aleatório
Um efeito fixo é estimado para cada nível que interessa (cada cultivar comparada). Um efeito aleatório trata os níveis observados como sorteio de uma população maior (fazendas, animais, anos) e estima a variância entre eles; modelos com os dois tipos são chamados mistos.
Nível
Cada valor que um fator assume no estudo: as doses 0, 50 e 100 kg/ha são três níveis do fator dose.

Quando usar

Use para comparar efeitos previstos entre níveis de um grupo aleatório e localizar níveis distantes da média.

Configuração

Grupo seleciona o termo aleatório; intervalo (IC, ± 1 EP ou ± 2 EP), confiança (o nível do IC, 0,95 por padrão), faixa de desvio padrão e ordenação controlam a exibição.

Exemplo

Exemplo de modelos
Modelo misto
Gráfico de lagarta
library(trama)

reg <- tr_registry()
tr_use("trama.models", registry = reg)

tr_flow(reg) |>
  tr_add("dados", "models/example", dataset = "sleepstudy") |>
  tr_add("ajuste", "models/lmer", formula = "Reaction ~ Days + (Days | Subject)", from = "dados") |>
  tr_add("resultado", "models/plot_caterpillar", grupo = "Subject", from = "ajuste")

No ajuste Reaction ~ Days + (Days | Subject), o gráfico ordena os efeitos de sujeito e mostra seus intervalos; valores que cruzam zero não se distinguem claramente do intercepto médio.

Como interpretar

Zero é o efeito médio populacional. Intervalo contendo zero não distingue aquele nível do valor médio no nível de confiança mostrado.