Coleção modelos

Quadro da ANOVA

O quadro da análise de variância, com SQ tipo I, II ou III e a régua do p-valor por termo.

O que o bloco faz

models/anova_table Monta o quadro de efeitos com graus de liberdade, somas de quadrados, estatísticas e p-valores. A saída é models/effects.

Antes de continuar

Termos que esta página usa, em poucas palavras. As definições completas estão no glossário.

p-valor
A probabilidade de obter um resultado tão extremo quanto o observado, ou mais, se a hipótese nula fosse verdadeira. p-valor pequeno indica dados pouco compatíveis com a hipótese nula; ele não é a probabilidade de a hipótese nula ser verdadeira nem mede o tamanho do efeito.
Graus de liberdade
Quantas informações independentes sobram para estimar uma variabilidade depois de estimados os outros parâmetros. Definem qual distribuição t, F ou qui-quadrado se usa no teste; com poucos graus de liberdade a inferência fica mais incerta.
Estatística F
A razão entre duas estimativas de variância: a explicada por um fator e a residual. Valores muito maiores que 1 indicam que o fator explica mais variação do que o acaso explicaria; é a estatística da análise de variância.
Modelo linear
Um modelo em que a resposta é a soma de efeitos das variáveis explicativas, cada um multiplicado por um coeficiente, mais um erro aleatório. Regressão e análise de variância são casos dele; “linear” se refere aos coeficientes, não à forma da curva.
Análise de variância (ANOVA)
Um método que divide a variação total da resposta em partes atribuídas a cada fonte (tratamentos, blocos, erro) e testa, pela estatística F, se cada fonte explica mais variação do que o acaso.

Quando usar

Use para inspecionar o teste global de cada termo do ajuste e escolher como as somas de quadrados respondem ao desbalanceamento.

Pressupostos

  • Os pressupostos do modelo que entra (normalidade e variância constante do erro nos modelos lineares; família e ligação no GLM) valem: o quadro só lê o ajuste.

    Verificar:Normalidade dos resíduosLeveneDiagnóstico dos resíduos

  • No tipo III, os fatores estão em contrastes de soma zero (o bloco reajusta sozinho, também no GLM misto e no GLS; o lmerTest já é invariante ao contraste). Uma covariável numérica em interação com fator não é centrada: o efeito principal do fator é testado com a covariável em zero, e a nota avisa. No tipo I, a ordem dos termos na fórmula é a ordem das perguntas.

    Se falhar: No desbalanceado, prefira o tipo II quando não há interação, e o III quando há.

Configuração

Soma de quadrados aceita I, II ou III. Tipo I é sequencial; II ajusta pelos outros efeitos principais; III inclui todos os termos.

Exemplo

Exemplo de modelos
ANOVA · DBC
Quadro da ANOVA
library(trama)

reg <- tr_registry()
tr_use("trama.models", registry = reg)

tr_flow(reg) |>
  tr_add("dados", "models/example", dataset = "milho_dbc") |>
  tr_add("ajuste", "models/anova_dbc", resposta = "producao", tratamento = "hibrido", bloco = "bloco", from = "dados") |>
  tr_add("resultado", "models/anova_table", tipo_sq = "I", from = "ajuste")

A entrada é o ajuste DBC de produção: cada linha do quadro apresenta para tratamento e bloco os graus de liberdade, SQ tipo I, F e p-valor.

Como interpretar

Os tipos coincidem no desenho balanceado. Em dados desbalanceados, escolha o tipo conforme a hipótese e a ordem do modelo.

Implementação

  • nlme::anova.gls() versão 3.1.168No GLS, type = "sequential" (tipo I) ou "marginal" (tipo III, com os fatores reajustados em contr.sum).
  • stats::anova() versão 4.6.0Tipo I (lm, glm: F ou qui-quadrado conforme a dispersão da família); no misto, anova do lmerTest com gl de Satterthwaite.
  • car::Anova() versão 3.1.5Tipos II e III (type = 2 ou 3); no tipo III o modelo (também o glmer) é reajustado com contr.sum. No GLM, test.statistic = "F" ou "LR".

No código O bloco chama trama.models::tr_models_anova_table(), em trama.models/R/resumir.R:195.

A conta é feita nestas chamadas:

Outras funções de pacotes que o bloco usa (22)

Referências

Livro-texto

  • Searle, S. R. (1971). Linear Models. New York: Wiley.
  • Fox, J.; Weisberg, S. (2019). An R Companion to Applied Regression. 3. ed. Thousand Oaks: Sage.
  • Montgomery, D. C. (2017). Design and Analysis of Experiments. 9. ed. Hoboken: Wiley.

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